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GelRed核酸染料的高靈敏度和安全性

更新時(shí)間:2016-09-14  |  點(diǎn)擊率:1932
   GelRed核酸染料是集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身的的熒光核酸凝膠染色試劑。其水溶染色劑通過(guò)美國(guó)環(huán)保局安全認(rèn)定,廢棄物可直接倒入下水道,而不會(huì)造成任何環(huán)境污染。

  GelRed核酸染料無(wú)論用于預(yù)制凝膠染色還是凝膠電泳后染色,都表現(xiàn)出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統(tǒng)而設(shè)計(jì)的 GelRed ,在使用了我們新開(kāi)發(fā)的具有的試驗(yàn)步驟后(該試驗(yàn)步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統(tǒng)的 TBE 緩沖溶液),在凝膠電泳后染色中優(yōu)于或者至少相當(dāng)于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同, GelRed核酸染料在預(yù)制凝膠中使用時(shí)仍然有*的靈敏度,事實(shí)上GelRed 在檢測(cè)低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現(xiàn)出更高的靈敏度,尤其對(duì)小分子量的 DNA 檢測(cè)非常靈敏。

  GelRed核酸染料可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見(jiàn)光激發(fā)的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無(wú)論是在預(yù)制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當(dāng),但不存在后者的不穩(wěn)定性問(wèn)題。實(shí)際上, GelRed核酸染料,特別是 GelRed 非常穩(wěn)定,可以長(zhǎng)期在室溫下保存。當(dāng)這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時(shí)甚至可以使用微波爐加熱,便于采用常規(guī)方法制備預(yù)制凝膠。含有染料的預(yù)制凝膠可以成批制備,長(zhǎng)期保存。

  同樣重要的是, GelRed核酸染料相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。 獨(dú)立的測(cè)試服務(wù)公司( Litron Laboratories, Inc. )進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)艾姆斯氏測(cè)試結(jié)果表明, 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠(yuǎn)高于推薦用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )濃度下, GelGreen 沒(méi)有誘變性,而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時(shí)有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學(xué)結(jié)構(gòu)使其難以穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞,正是這一特性降低了染料的細(xì)胞毒性。相反, SYBR Green I 廣泛地用于活細(xì)胞線粒體和核 DNA 染色,這正是由于它能快速的被細(xì)胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對(duì)紫外線導(dǎo)致的突變有強(qiáng)烈的增強(qiáng)作用,因此它的高細(xì)胞膜透性使它在紫外環(huán)境觀察時(shí)成為凝膠染色的主要有害物質(zhì)。

  GelRed核酸染料的使用方法

  將100ml瓊脂糖凝膠溶液(濃度一般為0.8%~2%)在微波爐中融化。

  加入5-10µl GelRed核酸染料(如果背景過(guò)高可以適當(dāng)減少用量,如果敏感度過(guò)低,可以適當(dāng)增加用量),輕輕搖勻,避免產(chǎn)生氣泡。

  冷卻至不燙手時(shí)倒膠,待瓊脂糖凝膠*凝固后上樣電泳。

  電泳完畢在紫外燈下觀察。若使用數(shù)碼相機(jī)照像記錄,則關(guān)閉相機(jī)的閃光燈,放在自動(dòng)檔即可;若使用凝膠成像系統(tǒng)照相,通過(guò)調(diào)節(jié)光圈、曝光時(shí)間,選擇合適的濾光片,可得到成像清晰、背景較低的照片。

  GelRed核酸染料使用時(shí)的注意事項(xiàng)

  1. 膠厚度不宜超過(guò)0.5cm,膠太厚會(huì)影響檢測(cè)的靈敏度。加入GoldenView的瓊脂糖凝膠反復(fù)融化可能會(huì)對(duì)核酸檢測(cè)的靈敏度產(chǎn)生一定影響,但不明顯。通過(guò)凝膠電泳回收DNA片段時(shí),建議使用GelRed核酸染料染色,在自然光下切割DNA條帶,避免紫外線與EB對(duì)目的DNA產(chǎn)生的損傷,可明顯提高克隆、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)錄等分子生物學(xué)下游操作的效率。

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